Wichtiger Bestandteil des umfangreichen musikpädagogischen Engagements der Jenaer Philharmonie sind die speziellen Schul- bzw. Schülerprojekte.  An primärer Stelle steht dabei das sogenannte „lernende Handeln“. Hier heißt es mitmachen, mitgestalten, sich ausprobieren. Alles in allem: kreativ und schöpferisch aktiv sein.
Die Philharmonische Gesellschaft fördert die Schulprojekte der Jenaer Philharmonie mit besonderer Aufmerksamkeit.

Schülerprojekt "Kindheitspoesie" im Januar 2010

Das interaktive Kinderkonzert fand am 17. Januar 2010, 11:00 Uhr im Jenaer
Volkshaus statt und wurde von den Schülern der Lobdeburgschule mitgestaltet.

Schülerprojekt „Bilder einer Ausstellung“ im Februar 2009

Das Projekt fand vom 13. Bis 16. Februar 2009 mit den Schülern der Klassen 5 a und 5 b der Ganztagsschule "Maria Montessori" in Jena statt.